百創DG1000利用Droplet、油滴包裹、Barcode等技術實現高通量的細胞捕獲。可在極短的時間內(110S)完成油包水的過程;儀器設計輕巧便攜;儀器使用的百創C1000芯片為自主設計的2×4獨立芯片,可根據上樣數量進行靈活調整;同時本產品還具有配套的分析軟件BSCMatrix。
種類約為88萬種,每個膠珠之上有千萬級的探針,每條探針包括四個部分,通用測序引物R1,cell barcode,UMI,poly(dT)VN ,這里我們設計了更長的CB有54個bp,更長的CB可以更好的去兼容三代測序,尤其是ONT測序,可以提升識別效率。
單細胞測序流程 | 外包科研服務 | 自己操作 |
實驗周期 | ?10d | 1?2d |
分析周期 | ?10d | 1?2d |
是否需要運輸 | 運輸時間需1?2d,可能導致細胞活性較低 | 不需運輸,現場解離,細胞活性高 |
樣品編號 | 數據量 | 上機理論細胞數 | 細胞數 | 捕獲效率 | 中位基因數 | 中位UMI數 | 總檢測基因數 |
T01 | 108.5G | 10,000 | 6,598 | 66% | 1,184 | 2,249 | 34,590 |
T02 | 101.5G | 10,000 | 6,004 | 60% | 1,092 | 1,965 | 33,798 |
T03 | 93.6G | 10,000 | 5,366 | 54% | 1,173 | 2,171 | 34,865 |
樣品編號 | 數據量 | 上機理論細胞數 | 細胞數 | 捕獲效率 | 中位基因數 | 中位UMI數 | 總檢測基因數 |
DG1000 | 53.7G | 5,000 | 2,735 | 54% | 1,315 | 3,217 | 18,657 |
主流平臺 | 54.5G | 10,000 | 5,292 | 53% | 958 | 1,228 | 15,777 |